В 2006 году был убит 1 гражданский активист, пропали без вести, предположительно, похищены - 2, избиты - 18, 15 - подвергнуты уголовному преследованию, 270 - были задержаны за организацию и участие в публичных мероприятиях.
Наиболее громкими фактами, вызвавшими большой общественный резонанс, стали летние массовые задержания милиционерами участников двух оппозиционных форумов (конференции "Другой России" и Российского социального форума); осуждение нижегородского правозащитника Станислава Дмитриевского в феврале; задержание в том же месяце руководителей крупных правозащитных организаций в Москве около здания ФСБ России.
Ассоциация отмечает отдельных лидеров организаций: Романа Доброхотова ("Мы", Москва), Романа Юшкова (экологическая организация "Зеленая ойкумена", Пермь) и Александра Брагина (ульяновское отделение ОГФ), которые в 2006 году неоднократно сталкивались с проблемой преследования. Также Ассоциация выделяет правозащитника Станислава Дмитриевского, признанного судом виновным в разжигании национальной розни за публикацию в газете (Общество Российско-Чеченской Дружбы, Нижний Новгород).
Под гражданским активистом в мониторинге Ассоциации понимается человек, систематически занимающийся общественной деятельностью, направленной на защиту прав человека и интересов личности от незаконных действий представителей власти, действующий в составе организации либо единолично. К гражданским активистам в данном случае не относятся журналисты и адвокаты, сталкивающиеся с преследованием в связи с осуществлением своей профессиональной деятельности, члены политических партий в связи с политической деятельностью, а также представители государства, уполномоченные российским законодательством защищать права человека. Под гражданской организацией понимается объединение таких людей.
